Описание

Введение

Цель исследования, представленного в статье, заключается в изучении возможности дифференциации типичных и генетически измененных штаммов Vibrio cholerae биовара Эль-Тор с использованием метода MLvA (многофакторный анализ переменных тандемных повторов). Авторы стремятся оценить генетическое разнообразие геновариантов и выяснить их филогенетические связи с классическим биоваром Vibrio cholerae и предпандемическими штаммами. Актуальность данного исследования обусловлена продолжающейся пандемией холеры и необходимостью мониторинга эпидемического потенциала различных штаммов, что имеет важное значение для общественного здравоохранения.

Методология

В исследовании использованы 60 штаммов Vibrio cholerae, из которых 52 относятся к биовару Эль-Тор, а 8 — к классическому биовару. Для типирования применялся метод MLvA, основанный на сравнительном анализе пяти вариабельных локусов генома. Выбор данного метода обусловлен его высокой разрешающей способностью по сравнению с другими методами молекулярного типирования, такими как SNP и MLST. Анализ ДНК проводился с использованием программного обеспечения для секвенирования и построения филогенетических деревьев.

Основные результаты

Исследование показало, что все 60 штаммов относятся к 38 различным MLvA-типам и входят в состав семи клональных кластеров. Кластеры I и II включают классические штаммы и предпандемические изоляторы, тогда как кластеры III–VII состоят из штаммов биовара Эль-Тор, выделенных в разные временные периоды текущей пандемии. Установлено, что генетически измененные штаммы отличаются более высоким уровнем вирулентности и наличием гена ctxB классического типа. Статистическая значимость результатов подтверждена различиями в аллельных профилях между типичными и измененными штаммами.

Обсуждение и интерпретация

Авторы интерпретируют результаты как свидетельство поликлонального происхождения различных геновариантов V. cholerae. Сравнение с предыдущими исследованиями показывает наличие как подтверждений, так и противоречий существующим теориям о происхождении холерных вибрионов. В частности, выявленная возможность дифференциации геновариантов по структуре острова пандемичности vSP-II может служить индикатором их эпидемического потенциала.

Заключение

Основные выводы статьи подчеркивают важность применения метода MLvA для дифференциации штаммов V. cholerae на типичные и генетически измененные, а также для мониторинга их эпидемического потенциала. Практическая значимость результатов заключается в возможности использования данных для разработки стратегий контроля за распространением холеры. Ограничения исследования связаны с необходимостью дальнейшего изучения поликлонального происхождения геновариантов. Рекомендуется продолжить исследования по выявлению источников инфекции и мониторингу новых вариантов Vibrio cholerae. Ключевые слова: Vibrio cholerae; геноварианты; аллель гена ctxB; остров пандемичности VSP-II; MLVA-типирование. Библиография: Chun J., Grim C.J., Hasan N.A., et al. Comparative genomics reveals mechanism for short-term and long-term clonal transitions in pandemic Vibrio cholerae. Dziejman M., Balon E., Boyd D., et al. Comparative genomic analysis of Vibrio cholerae: genes that correlate with cholera endemic and pandemic disease. Davis B.M., Waldor M.K. Filamentous phages linked to virulence of Vibrio cholerae. Olsvik O., Wahlberg J., Petterson B., et al. Use of automated sequencing of polymerase chain reaction-generated amplicons to identify three types of cholera toxin subunit B in Vibrio cholerae O1 strains. Frerichs R.R., Keim P.S., Barrais R., Piarroux R. Nepalese origin of cholera epidemic in Haiti. Khuntia H.K., Pal B.B., Samal S.K., Kar S.K. Rapid spread of Vibrio cholerae O1 El Tor variant in Odisha, Eastern India. Okada K., Roobthaisong A., Swaddiwudhipong W., et al. Vibrio cholerae O1 isolate with novel genetic background. Rashed S.M., Azman A.S., Alam M., et al. Genetic variation of Vibrio cholerae during outbreaks in Bangladesh. Son M.S., Megli C.J., Kovacikova G., et al. Characterization of Vibrio cholerae O1 El Tor biotype variant clinical isolates from Bangladesh and Haiti. Morita M., Ohnishi M., Arakawa E., et al. Emergence and genetic diversity of El Tor Vibrio cholerae O1 that possess classical biotype ctxB among travel-associated cases of cholera in Japan.